Сын легендарного авиаконструктора, стоявшего у истоков развития конструкторского бюро, которое теперь носит его имя. Мама его, Екатерина Медникова, работала летчиком-испытателем в КБ мужа.
30 лет работы в ОКБ имени своего отца, в котором начинал рядовым инженером в 1962 году, до 1997 года работал в должности заместителя генерального конструктора. С 1997 года главный конструктор в преобразованном КБ «Яковлева» – ЗАО «Самолеты Яковлева», где до 2016 года параллельно работе главного конструктора возглавлял Совет директоров.
Он не просто продолжил дело своего отца, он внёс огромный вклад в развитие самолетостроения в нашей стране. Не только непосредственно участвовал в проектировании, Сергей Александрович руководил летными испытаниями. Уже будучи на пенсии участвовал в мероприятиях родного коллектива АО «Опытно-конструкторское бюро им. А. С. Яковлева», вносил посильный вклад в дело воспитания молодежи: участвовал в создании экспозиции «Битва за оружие Великой Победы».
Сергей Яковлев вместе с родным предприятием пережил трудные времена. В 2004 году предприятие практически перестало существовать. Была распродана производственная база, сокращен почти весь персонал, распродана недвижимость. Оставшаяся часть сотрудников сформировала инженерный центр «НПК Иркут». В июле 2023 года возвращено наименование ОКБ им. Яковлева. Предприятие находится под санкциями США, Канады, Японии, Украины, всех стран ЕвроСоюза.
На счету проектировщика Сергея Александровича Яковлева – легендарный сверхзвуковой истребитель вертикально-взлета-посадки Як – 141; ближнемагистральный пассажирский самолёт Як – 142, реактивно-пассажирские самолёты: Як – 40, Як-42; спортивно-акробатические — Як-18ПМ, Як-18ПС; лёгкие самолёты — Як-50, Як-52, Як-55 и Як-55М, Як -18Е, Як- 58, универсальный лёгкий самолёт связи Як-10. Он создал летающую копию отцовского самолёта — Як-3.
Первый беспилотный советский разведчик «Пчела-1» - его творение. Имеет 30 патентов на изобретения.
Сергей Яковлевич награждён Орденом Трудового Красного Знамени, медалями, Лауреат Государственной Премии СССР.
Светлая память выдающемуся конструктору, светлому человеку Сергею Александровичу Яковлеву!